Der Markt Kirchseeon ist eingebunden in das Verbundnetz des MVV. Die S-Bahn-Linie 4 Ebersberg - Geltendorf verkehrt im 20-Minuten-Takt. Unterstützend fährt zu den Stoßzeiten zusätzlich die Linie S 6. Dadurch wird ein 10-Minuten-Takt erreicht. Über die beiden Bahnhöfe Kirchseeon und Eglharting ist der Markt sehr gut angebunden. Die Fahrzeit nach München beträgt nur 25 Minuten. Das ganze Verkehrsnetz des Münchener Verkehrsverbunds MVV mit der Fahrplanauskunft online finden Sie unter "Weiterführende Links" am Ende dieser Seite.
Außerdem besteht ein regionaler Busverkehr (Linie 442) der zwischen Grafing Bahnhof - Ebersberg - Kirchseeon - und Eglharting, Westring verkehrt.
Die Haltestellen in Kirchseeon und Eglharting sind: Kirchseeon Dorf (Ost), Kirchseeon - S-Bahn, Waldbahn, Ahornstraße, Eglharting - S-Bahn, Bucherstraße, Westring.